Uit botsproeven van Euro NCAP (European New Car Assessment Programme) is gebleken dat Daihatsu niet alleen op het gebied van milieuvriendelijkheid, maar ook op het gebied van veiligheid vooruitgang boekt. De Sirion 2 behaalde vier sterren voor de bescherming van volwassenen na een frontale en zijdelingse botsproef.

De Daihatsu Sirion 2 is standaard uitgerust met zowel airbags voor de bestuurder en passagier als zij-airbags. Veiligheidsbalken in de vier portieren beschermen alle inzittenden bij een zijdelingse aanrijding. De auto kreeg extra punten voor het waarschuwingssysteem voor het gebruik van autogordels. De Sirion 2 is verder voorzien van ISOFIX-bevestiging voor kinderzitjes, waardoor ook de allerkleinsten veilig vervoerd kunnen worden. Voor de bescherming van kinderen kreeg de Sirion 2 drie sterren en voor de bescherming van voetgangers twee sterren.