Mercedes-Benz past de succesvolle Prestige-formule voortaan ook toe op de CLS-klasse. Eerder kreeg de S-Klasse al een extra luxe variant. De Prestige-uitvoering is beschikbaar voor zowel de CLS 320 CDI als de CLS 350 CGI.

Het Prestige-pakket omvat onder meer lederen bekleding en stoelverwarming voor de voorstoelen. Ook het geavanceerde COMAND APS-systeem met geïntegreerde radio, cd- en dvd-speler met afspeelmogelijkheid voor mp3-bestanden en dvd-kaartnavigatie maakt deel uit van de uitrusting van deze versie. De elektronische parkeerhulp Parktronic en metallic lak zijn eveneens inbegrepen. Daarnaast is de CLS Prestige voorzien van bi-xenon koplampen met actieve bochtenverlichting en afslagverlichting.

Alle voorzieningen bij elkaar vertegenwoordigen een waarde van 9.729 euro. De meerprijs bedraagt echter 6.800 euro. De besparing van 2.929 euro komt neer op een voordeel van 30 procent. De CLS Prestige is slechts beperkt leverbaar.